Cuando hay programas simples y útiles, vale la pena mencionarlos y destacarlos.

El programa rsync es un programa para linux por línea de comandos  que permite sincronizar dos archivos y/o directorios, no necesariamente dentro de la misma máquina, si no que además puede sincronizar entre servidores ya sea a través de ssh o mediante su propio demonio rsync.  Es muy fácil de usar, por ejemplo:

rsync -avz mipc.netred.cl:/home/misitioweb/ /data/misitioweb

con esto pude mover mi sitio web de un servidor a otro con solo un comando. Excelente!